PAINEL TUMORAL AMPLIADO

Sigla: PTUMORAMP    

Nome: Perfil Tumoral Ampliado, Vários Materiais 

Prazo: Em até 30 dias corridos

.:: Condições para envio 

 

- A análise é feita em material enviado ou coletado no laboratório.

 

AMOSTRA:

 

Material coletado no laboratório:

- O teste pode ser realizado em fragmentos de tecido⁄biópsias fixados em formalina, que tenham material suficiente, colhidos no laboratório.

- Abrir exame anatomopatológico (ANATPATP) e seguir o fluxo deste exame.

 

- Lâminas ou bloco(s) de parafina coletados fora do laboratório e enviados para análise (MATERIAL ENVIADO).

- Poderão ser aceitos os seguintes materiais:

- Fragmentos de tecido fixados em formalina 10% tamponada, embebidos ou não em parafina (enviar em temperatura ambiente);

- Caso sejam enviadas somente lâminas para a análise, são necessárias no mínimo 16 (dezesseis) lâminas em branco (não coradas), não montadas; seção de 5µm de espessura, em porta-lâminas.

 

PROCEDIMENTO:

 

Lâminas, material fixado e⁄ ou bloco de parafina, MATERIAL ENVIADO, ou fragmento de tecido,

 

- Fragmentos de tecido fixados em formalina 10% tamponada, embebidos ou não em parafina;

- Lâminas de corte histológico;

 

- Encaminhar o material para Distribuição, em temperatura ambiente.

 

ATENÇÃO: Não serão aceitas lâminas com resina ou material fora das condições citadas acima.

 

- O tecido deve ter sido fixado previamente em formalina tamponada o mais rápido possível após a biópsia ou cirurgia. A fixação deve ser de, no mínimo, seis horas e, no máximo, 72 horas. A adoção de cuidados na coleta e na fixação da amostra garantem o sucesso do teste. - Caso seja enviado fragmento de tecido sem análise prévia (biópsia), o material deverá ser submetido a exame anatomopatológico (abrir item ANATPATP ou ANATPATPTE) para confirmação do diagnóstico naquela amostra.

- É necessário que a amostra tenha células tumorais não necróticas presentes em quantidade superior a 20%.

- É importante salientar que o material enviado sempre será analisado por um médico patologista antes da realização do exame. Dessa forma, se o material enviado for insuficiente ou inadequado para o teste, o mesmo não poderá ser realizado.

Metodologia 

As amostras tumorais fixadas serão avaliadas por médico patologista que fará a seleção da área tumoral representativa. Dez seções de cada tumor serão utilizadas para a extração do DNA e de RNA. O protocolo segue um preparo inicial para a fragmentação das moléculas de DNA e inserção de adaptadores com indexes únicos e um outro preparo individualizado para a inserção de adaptadores com indexes distintos para as moléculas de RNA. Em seguida, as moléculas de DNA e RNA são misturadas para a realização da etapa de enriquecimento das regiões de interesse por captura híbrida. A captura de toda a região codificante de 421 genes e regiões de fusões gênicas de 50 genes é realizada por meio de um painel customizado e, em seguida, sequenciada simultaneamente no equipamento NextSeq500 (Illumina). Os dados do sequenciamento são processados em um pipeline de bioinformática desenvolvido e validado internamente. As variantes identificadas e filtradas nesse pipeline passam por uma anotação gênica que utiliza a inteligência artificial IBM Franklin by GENOOX. Os resultados de cada caso são discutidos individualmente por uma equipe multidisciplinar composta por médicos patologistas moleculares, geneticistas e equipe técnico-científica para a confecção do laudo.